Jméno vesnice, původně Kojytín, se odvozuje od zakladatele Kojaty. Domy, vesměs nejnovějšího rázu, stavěné z kamene a cihel, tvoří malou náves. Osada je velmi stará. První zmínka o ní se nachází už v zakládací listině třebíčského kláštera z doby okolo roku 1104. I s tvrzí byla nejspíš zničena za česko-uherských válek ve druhé polovině 15. století, protože se roku 1556 v listině krále Ferdinanda I., jíž dostal Vratislav z Pernštejna třebíčské panství do dědičného vlastnictví, připomíná pouze jako pustá. Přes 200 let nebyla obsazena. K novému vystavění Kojatína došlo roku 1712.
